O Jardim foi inaugurado inicialmente em Vila Isabel por volta de 1888 e transformado na Fundação Rio Zoo em 1985.
O portão do Zoológico foi encomendado por Dom João VI em 1807 ao Duque de Northemberland originalmente para a frente da Quinta. Tinha como inspiração o pórtico da residência de campo do nobre inglês, a Syon House, e foi uma das primeiras providências de D. João no sentido de embelezar a propriedade ora recebida como doação à Corte pelo comerciante Elias Antônio Lopes.
Tendo sido enviado para o Brasil em 1813, o portão custou cerca de 800 (oitocentas) libras esterlinas e nunca foi pago ao Duque. No início do século mudou de local e hoje embeleza a entrada do Zoo.